Som biskop har Henrik Stubkjær mange arbejdsopgaver
At tage på visitats i stiftet Visitatsen forløber som en almindelig højmesse, efterfulgt af samtaler om blandt andet det folkekirkelige arbejde på stedet. Dette er blandt andet med til at danne baggrund for nye tiltag, der kan fremme det kirkelige liv i stiftet.
At føre tilsyn Tilsynet omfatter også præsternes virke, og det er biskoppen, der er den øverste myndighed i gejstlige anliggender og blandt andet godkender ændringer i liturgi. Eventuelle forsømmelser indberetter biskoppen til Kirkeministeriet. En del af tilsynet omfatter kirkebygninger, og det er biskoppen, der indvier nye kirker og godkender brug af kirker til andet end gudstjenester og kirkelige handlinger, ligesom biskoppen udpeger bygningskonsulenter vedrørende præstegårde og præstegårdskonsulenter.
Ansættelse af præster og provster Det er biskoppen der, sammen med menighedsrådene, ansætter præster, ligesom det er biskoppen der afholder bispeeksamen og ordinerer nye præster.
Strukturændringer Det er også biskoppen der fastlægger stiftets pastorale struktur.
Fællesfonden Biskoppen forestår administrationen af Fællesfonden
Stiftsadministrationen Biskoppen har den overordnede ledelse af Stiftsadministrationen.
Godkendeles af ansøgninger Sager om, at der kan forholdes med asken på anden sømmelig måde, afgøres af biskoppen. Bestemmelsen vedrører i praksis urnenedsættelse på privat grund samt deling af asken.
Viborg Stiftsråd Født medlem af Viborg Stiftsråd
Bestyrelses- og tillidsposter
Nomineret til medlem af LWF`s Council
Formand for World Service
Medlem af Mellemkirkeligt Råds Integrationsudvalg – Asylsamarbejdet
Medlem af Kristeligt Dagblads repræsentantskab
Bestyrelsesmedlem i Folkekirken.dk
Medlem af Styregruppen / følgegruppen for Kirken på Landet
Medlem af udvalget til drøftelse af præstestillinger og præsteløn
Kontaktperson for fængsels- og arresthuspræster (sammen med biskop Henrik Wigh Poulsen, Aarhus Stift)
Medlem af Aftagerpanelet – Århus Universitet – Teologi
Præcidiemedlem af UNICEF Danmarks præsidie
Bestyrelsesmedlem i Bogliselskabernes Fællessekretariat i Viborg
Bestyrelsesmedlem Bisp Gunnars, Viborg
Bestyrelsesmedlem i Dialog-forum og tænketanken RESAM
Medlem af "Projekt Hospice", Viborg
Medlem af "Projekt Domkirken" Viborg
Bestyrelsesformand Skærum Mølle
Bestyrelsesformand Møltrup Optagelseshjem
Bestyrelsesformand Viborg Katedralskole
Medlem af komité for fundraising, opdatering og udvidelse af KFUM Soldaterhjem, Skive
Medlem af bestyrelsen for Varmestuen i Viborg (Kirkens Korshær)
