Værnspræster er sognepræster, der som en del af deres rådighedstjeneste knyttes til en enhed eller et tjenestested indenfor Hæren, Søværnet eller Flyvevåbnet. Værnspræsten ansættes derfor i samråd med biskoppen og den lokale provst. 

Værnspræstetjenesten er organiseret med tre værnsprovster: Hærprovsten i Kastelskirken, Orlogsprovsten i Holmens kirke og Flyverprovsten i Viborg Domkirke, og det gejstlige tilsyn med værnspræstetjenesten varetages af Københavns biskop. 

Som værnspræst: feltpræst i Hæren, orlogspræst i Søværnet og flyverpræst i Flyvevåbnet bærer man uniform under sin tjeneste, med et kors som distinktion. En værnspræst står udenfor den militære rangfølge, idet man har samme rang, som den man taler med. Værnspræsten er underlagt samme tavshedspligt i sin tjeneste, som den der i øvrigt gælder for sognepræster. Når en værnspræst sendes med et dansk militært bidrag til udlandet, ansættes en vikar, betalt af Forsvaret, til at passe den udsendtes præsteembede.